肾母细胞瘤发生的原因有学者在1990年提出肾源性肾盂的概念。认为肾源性肾盂是肾母细胞瘤的前期病变。

       肾母细胞瘤发生于后肾胚基的肾盂细胞，后肾胚基细胞分化延滞、残留导致肾源性肾盂发生，通过动态观察发现，绝大多数肾源性肾盂最终退化消失，而那些不退化的肾源性肾盂可能进一步发展为肾母细胞瘤。现在越来越明确，一些遗传因素在肿瘤发生过程中起了一定的作用，WT1是首先被确定的，并且最为完整表达肾母细胞瘤的基因。

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